E100027648_L01_97样品中检测到了水稻细菌性条斑病菌和瓜类果斑病菌
水稻细菌性条斑病病原菌为稻生黄单胞杆菌稻细条斑致病变种（Xanthomonas oryzae pv. oryzicola (Fang et al.) Swing et al.），属薄壁菌门、假单胞细菌目、黄单胞杆菌属。
菌体杆状，大小1-2微米×0.3-0.5微米。多单生或个别成双链。有极生鞭毛1根，不形成芽孢和荚膜，革兰氏染色反应阴性。在肉汁胨琼脂培养基上菌落圆形，周边整齐，中部稍隆起，蜜黄色。该菌生长适温28-30℃。生理生化反应：该菌能使明胶液化，使牛乳胨化，使阿拉伯糖产酸，对青霉素、葡萄糖反应不敏感。
表1 不同测序深度水稻细菌性条斑病菌基因组覆盖度
| accession | genome_size(bp) | sequence_depth(X) | base_number | coverage(%) |
|---|---|---|---|---|
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 1 | 4207989 | 94.47 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 2 | 4046259 | 91.32 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 3 | 3730736 | 84.20 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 4 | 3261246 | 73.60 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 5 | 2698568 | 60.90 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 6 | 2143297 | 48.37 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 7 | 1667476 | 37.63 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 8 | 1299834 | 29.34 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 9 | 1043836 | 23.56 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 10 | 877639 | 19.81 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 11 | 771118 | 17.40 |
详细内容如下
测序深度1X的情况下，将样品中的reads比对到水稻细菌性条斑病菌基因组上。其覆盖率达到94.47%，因此可以判定此样品中存在水稻细菌性条斑病菌
瓜类果斑病菌（Acidovorax citrulli (Schaad et al.) Schaad et al.）属变形菌门、伯克霍尔德氏菌目、嗜酸菌属。
菌体短杆状，革兰氏染色阴性，不产生荧光，严格好氧，单根极生鞭毛。能在41℃下生长，不能在 4℃ 下生长。在 KB 培养基上呈现乳白色、圆形、光滑、全缘、隆起、不透明菌落，菌落直径 1 ～ 2mm。
表2 不同测序深度瓜类果斑病菌基因组覆盖度
| accession | genome_size(bp) | sequence_depth(X) | base_number | coverage(%) |
|---|---|---|---|---|
| NC_008752.1 | 5352772 | 1 | 4080230 | 76.31 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 2 | 3867516 | 72.25 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 3 | 3722633 | 69.55 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 4 | 3722633 | 67.71 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 5 | 3450572 | 64.46 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 6 | 3289258 | 61.45 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 7 | 3091243 | 57.75 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 8 | 2853371 | 53.31 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 9 | 2576095 | 48.13 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 10 | 2266889 | 42.35 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 11 | 1940767 | 36.26 |
详细内容如下
测序深度1X的情况下，将样品中的reads比对到瓜类果斑病菌基因组上。其覆盖率达到76.31%，因此可以判定此样品中存在瓜类果斑病菌