E100029464_L01_47样品中检测到了水稻细菌性条斑病菌和瓜类果斑病菌
水稻细菌性条斑病病原菌为稻生黄单胞杆菌稻细条斑致病变种（Xanthomonas oryzae pv. oryzicola (Fang et al.) Swing et al.），属薄壁菌门、假单胞细菌目、黄单胞杆菌属。
菌体杆状，大小1-2微米×0.3-0.5微米。多单生或个别成双链。有极生鞭毛1根，不形成芽孢和荚膜，革兰氏染色反应阴性。在肉汁胨琼脂培养基上菌落圆形，周边整齐，中部稍隆起，蜜黄色。该菌生长适温28-30℃。生理生化反应：该菌能使明胶液化，使牛乳胨化，使阿拉伯糖产酸，对青霉素、葡萄糖反应不敏感。
表1 不同测序深度水稻细菌性条斑病菌基因组覆盖度
| accession | genome_size(bp) | sequence_depth(X) | base_number | coverage(%) |
|---|---|---|---|---|
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 1 | 773423 | 17.76 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 2 | 685750 | 15.48 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 3 | 633897 | 14.31 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 4 | 590937 | 13.34 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 5 | 556531 | 12.56 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 6 | 526854 | 11.89 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 7 | 501109 | 11.31 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 8 | 478421 | 10.80 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 9 | 457327 | 10.32 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 10 | 437542 | 9.87 |
| NZ_CP007810.1 | 4430829 | 11 | 418464 | 9.44 |
详细内容如下
测序深度1X的情况下，将样品中的reads比对到水稻细菌性条斑病菌基因组上。其覆盖率达到17.46%，因此可以判定此样品中存在水稻细菌性条斑病菌
瓜类果斑病菌（Acidovorax citrulli (Schaad et al.) Schaad et al.）属变形菌门、伯克霍尔德氏菌目、嗜酸菌属。
菌体短杆状，革兰氏染色阴性，不产生荧光，严格好氧，单根极生鞭毛。能在41℃下生长，不能在 4℃ 下生长。在 KB 培养基上呈现乳白色、圆形、光滑、全缘、隆起、不透明菌落，菌落直径 1 ～ 2mm。
表2 不同测序深度瓜类果斑病菌基因组覆盖度
| accession | genome_size(bp) | sequence_depth(X) | base_number | coverage(%) |
|---|---|---|---|---|
| NC_008752.1 | 5352772 | 1 | 2530867 | 47.28 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 2 | 1314306 | 24.55 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 3 | 638577 | 11.93 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 4 | 313217 | 5.85 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 5 | 165785 | 3.10 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 6 | 98983 | 1.85 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 7 | 67640 | 1.26 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 8 | 48434 | 0.90 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 9 | 36930 | 0.69 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 10 | 28338 | 0.53 |
| NC_008752.1 | 5352772 | 11 | 22637 | 0.42 |
详细内容如下
测序深度1X的情况下，将样品中的reads比对到瓜类果斑病菌基因组上。其覆盖率达到47.28%，因此可以判定此样品中存在瓜类果斑病菌